Klimakrisen nevnes ikke med ett ord i «Bondegården», men er likevel filmens sterke drivkraft. Et amerikansk ektepar fra storbyen bestemmer seg for å rydde nytt land og bygge opp en gård helt og holdent etter miljøvennlige prinsipper. 80 hektar land skal forvandles til et fruktbart jordbruk, med så mange ulike planter og dyr som overhodet kan samordnes i et nytt, sunt og velfungerende mikrokosmos. Ekteparet vet at deres eksperiment kan åpne opp for et mylder av miljøvennlige nyvinninger, men i møtet med naturen slik den faktisk arter seg blir John og Molly små og hjelpeløse. Til slutt ser drømmen ut til å gå i knas.