Filmen utspiller seg på 2300-tallet. Det kaptein Jean-Luc Picard har fryktet i mange år skjer. Nok en borgkube ankommer til jorden for å assimilere den. Tross at Star Fleet ødelegger borgkuben, klarer en mindre kapsel fra kuben å unnslippe. Den åpner en tidsvirvel og reiser tilbake i tiden til midten av 2000-tallet for å forsøke å ødelegge menneskets første kontakt med sivilisasjonen fra Vulcan.