Harry Potters sjette skoleår ved Hogwarts-skolen for heksekunster og trolldom omgis av redsel og advarsler. Til tross for dette lykkes han endelig med sine leksjoner i trolldrikk takket være notater i læreboken han har lånt og som en gang tilhørte noen som kaller seg "halvblodsprinsen". Samtidig får han privattimer av Albus Dumbledore, som avslører hemmeligheten bak Voldemorts udødelige sjel.